一、食品机械在欧盟进行CE认证时主要依据以下指令：
1. 机械指令 (Machinery Directive)：2006/42/EC。这是欧盟对机械设备及其安全部件在欧洲市场销售的基本法规，确保机械设备的安全性、健康与环保要求，并为市场准入提供统一的框架。
2. 低电压指令 (Low Voltage Directive)：2006/95/EC。该指令规定了电气设备的安全标准，以确保在电压不超过特定值的情况下，设备的安全性。
3. 电磁兼容指令 (Electromagnetic Compatibility Directive)：2004/108/EC。此指令要求设备在电磁环境中的正常运作，且不对其他设备产生不适当的电磁干扰。
二、食品机械CE认证的流程通常包括以下几个步骤：
1. 项目申请：企业向检测机构递交CE认证申请。
2. 资料准备：根据CE认证的要求，企业准备好相关的认证文件，包括产品说明书、产品信息等。
3. 产品测试：企业将待测样品寄到实验室进行测试，测试可能涵盖电气安全性、机械安全性、卫生和卫生要求等方面。
4. 编制报告：认证工程师根据合格的检测数据，编写技术文件和测试报告。
5. 递交审核：工程师将完整的报告进行审核，确保所有测试结果符合CE认证的要求。
6. 签发证书：报告审核无误后，颁发CE认证证书。
此外，办理食品加工机械CE认证时，还需要注意以下几点：
- 确定适用的CE标准，包括机械指令2006/42/EC、低电压指令2006/95/EC和电磁兼容指令2004/108/EC。
- 产品的旋转部件应当处于封闭的环境中并配备互锁装置，如搅拌叶轮上面应配备盖并能保证盖打开时叶轮停止运转。
- 生产线应当配备多个急停按钮或者配备紧急拉线开关。
- 若盛料设备离地面高度超过1600mm而需要对料进行检测，应当配备指示装置（如加刻度，读数计等）。
- 确保设备清洗无死角并保证清洁后的污水方便排成不残留。
以上步骤和注意事项是食品机械CE认证的基本流程和要求，确保产品符合欧盟的安全和卫生标准。